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臨床M2巨噬細胞相關基因輔助治療胰腺導管腺癌
發布時間： 2021-11-02 點擊次數： 1609次胰腺導管腺癌(PDAC)是全球七大癌癥相關死亡原因，也是最常見的人類惡性腫瘤之一。根據2018年全球癌癥統計，大約有45.9萬名新確診患者和近43.2萬人死亡患者。由于早期準確診斷和腫瘤快速進展等困難，大量PDAC（胰腺導管腺癌）病例在診斷時出現臨床晚期或遠處轉移。因此，開發新的、可靠的預后評估和療效預測指標以進一步推進針對性治療具有十分重要的意義。
越來越多的證據支持浸潤M2巨噬細胞在胰腺導管腺癌(PDAC)的腫瘤進展中起關鍵作用。然而，對M2巨噬細胞浸潤和中樞基因(FAM53B)在臨床結局和免疫治療中的生物學作用缺乏全面的分析。近期有一個研究團隊針對M2巨噬細胞相關基因表達進行研究，以期望能探索出評估PDAC預后及療效的新指標。
研究人員合并了兩個PDAC樣本數據集，GSE16515和TCGA-PAAD，以研究M2巨噬細胞分析的潛在作用。使用CIBERSORT算法獲得M2巨噬細胞圖譜，然后通過WGCNA發現與M2巨噬細胞相關較為顯著的模塊。然后，利用多cox回歸模型進一步確定模塊中的候選基因，最終確定5個關鍵基因。然后，建立了多基因風險模型和綜合預后圖。在后續分析和外部試驗組(ICGC-PACA-CA)中驗證其預后價值。隨后，研究潛在的信號通路和治療預測的風險評分。最后，進一步探討FAM53B在預后預測、免疫浸潤和免疫治療中的生物學功能，為PDAC的臨床治療策略提供可靠的見解。
22個候選基因的LASSO系數譜
為了進一步研究候選基因的預后價值，研究人員從TCGA-PAAD項目中提取了表達數據和隨訪信息。在單因素Cox分析的幫助下，鑒定了22個M2巨噬細胞相關基因，具有顯著的預后價值。并對這些hub基因進行了Lasso回歸，識別出PDAC中與預后相關的9個M2巨噬細胞相關基因。進行多因素COX回歸分析，確定5個M2巨噬細胞相關基因(FAM53B、SPINK2、ABCB4、GH1、INTU)為中心基因，所有這些基因均被認為是有益的預后指標(所有HRs <1,表S6)。使用HPA數據庫來探索PDAC樣品中的蛋白表達水平。結果顯示，相對于正常樣本，腫瘤組織中的蛋白(ABCB4、FAM53B和INTU)明顯失調。此外，在低表達和高表達基因亞組之間，生存分析顯示，大多數hub基因mRNA表達異常導致總體生存時間顯著不同。
采用ROC分析評估預后特征的預測價值
綜上所述，建立基于M2巨噬細胞的風險評分，可作為預測PDAC臨床結局的穩健的預測性生物標志物和預后指標，為PDAC的治療管理提供指導。
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